《上下两张嘴都肿了》罕见地采用了敌我双方均可造成队友伤害的设定，让玩家能够巧妙引导敌人相互攻击，坐享渔翁之利。游戏中的地形同样是一个重要的考虑因素，英雄的技能有击退机制，当敌人被击退至建筑物或者其他单位时会受到额外伤害。
玩家可以选择每一关都亲临战场进行指挥，也可以选择跳过，但跳过会失去用于角色提升的材料。然而，战棋部分的玩法并没有给人眼前一亮的感觉。作为辅助剧情代入的玩法，战棋并不能替代RPG中即时战斗带来的沉浸体验。当连贯的剧情中穿插一道战棋关卡，反而影响了玩家的阅读体验。
《上下两张嘴都肿了》的视觉小说加战棋的玩法模式并非业界首创，慢节奏的回合制战棋加上需要排兵布阵的策略要素增加了玩家的脑力负担，也淡化了剧情内容，以至于需要一些时间来回忆战斗前的剧情。
游戏的第二个问题在于开发时的资源分配不均。最直观的表现就是立绘水平的参差不齐。宣发时游戏以白毛角色为噱头吸引了一批“白毛控”，一系列精良的白毛立绘与人物剧情让喜爱白毛角色的玩家非常满足。但对于黑方的角色来说，待遇明显不如白方。如果细心观察，会发现不仅黑方与白方的美术水平不一，就连黑色阵营内部的画风也存在差异。
