《无人区编码6229Jm观天下事》游戏中的武器系统十分丰富多彩，涵盖了九大类武器，每种武器都有独特的攻击距离、动作帧数、挥动频率以及特殊动作。主角可同时装备一主一副两把武器，玩家常常需要根据敌人的特点灵活切换武器。
每种武器还分为多种流派，每种流派都有三种特定的战技，使用时需考虑诸如敌我距离、战技帧数和角色精力等因素。流派之间还存在克制关系，因此玩家需要根据敌人的流派来选择自己所持武器的流派，以达到克制的效果。
《无人区编码6229Jm观天下事》中流派克制关系是明显可见的，玩家能直接查看当前所选流派与敌人的关系，从而做出正确的选择。学习不同流派需要通过逛地图、完成支线任务等方式获取，而一些Boss的多阶段形态以及杂兵的不同流派克制关系也增加了游戏的操作难度。
除了武器和流派的切换，游戏还引入了两个进阶动作：紫电和烈风。紫电是在使用一把武器攻击后立即切换武器，触发附加攻击动作；而烈风则是在攻击后立即切换流派，触发附加攻击动作。
